Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam107bQ3TGF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam107bQ3TGF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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