Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stt3bQ3TDQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stt3bQ3TDQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms