Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms