Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr27Q3SYJ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr27Q3SYJ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms