Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm1Q2TV84 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trpm1Q2TV84 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms