Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smrp1Q2MH31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smrp1Q2MH31 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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