Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cers3Q1A3B0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms