Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Perm1Q149B8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Perm1Q149B8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Perm1Q149B8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Perm1Q149B8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Perm1Q149B8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Perm1Q149B8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Perm1Q149B8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Perm1Q149B8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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