Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spatc1Q148B6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spatc1Q148B6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spatc1Q148B6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spatc1Q148B6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spatc1Q148B6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spatc1Q148B6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spatc1Q148B6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spatc1Q148B6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spatc1Q148B6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms