Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms