Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim24Q0VG18 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms