Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc39dQ0VF76 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Ttc39dQ0VF76 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttc39dQ0VF76 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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