Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms