Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms