Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem52bQ0VBF2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms