Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntnap5bQ0V8T8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms