Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Neurl1bQ0MW30 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms