Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms