Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc4Q08624 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms