Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SctQ08535 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SctQ08535 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SctQ08535 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SctQ08535 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SctQ08535 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SctQ08535 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SctQ08535 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SctQ08535 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SctQ08535 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SctQ08535 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms