Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tgm3Q08189 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgm3Q08189 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms