Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnn2Q08093 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms