Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MestQ07646 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MestQ07646 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MestQ07646 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MestQ07646 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MestQ07646 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MestQ07646 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MestQ07646 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MestQ07646 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms