Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfe2Q07279 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms