Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms