Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CluQ06890 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CluQ06890 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CluQ06890 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CluQ06890 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CluQ06890 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms