Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igsf9Q05BQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf9Q05BQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms