Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPINDOCQ05AH6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms