Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprgQ05909 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprgQ05909 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms