Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox9Q04887 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox9Q04887 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms