Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox8Q04886 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms