Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx2Q04744 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms