Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk16Q04735 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk16Q04735 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms