Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Smarcad1Q04692 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smarcad1Q04692 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms