Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nf1Q04690 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nf1Q04690 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nf1Q04690 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nf1Q04690 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nf1Q04690 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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