Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thbs2Q03350 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms