Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ddr1Q03146 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms