Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gja5Q01231 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms