Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2cQ01098 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms