Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb2Q00977 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb2Q00977 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms