Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms