Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serpina1eQ00898 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Serpina1eQ00898 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms