Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms