Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apoa1Q00623 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms