Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata5P97489 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata5P97489 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata5P97489 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms