Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crmp1P97427 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms