Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LystP97412 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LystP97412 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LystP97412 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LystP97412 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LystP97412 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms