Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Lig3P97386 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig3P97386 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms