Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b3P97370 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b3P97370 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b3P97370 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1b3P97370 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp1b3P97370 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b3P97370 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms