Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms